Эхинопсис атакамский это кактус со столбовидным стеблем. Стебель достигает в высоту до шести метров, а в диаметре до семидесяти сантиметров, ветвится редко.
Этот кактус имеет многочисленные ребра. Колючки тонкие в количестве до сорока штук, в длину до десяти сантиметров.
Цветки белые до четырнадцати сантиметров в длину.