Лофофора желтая оправдывает свое название, так как и в стебле и в цветках присутствует желтый оттенок. Стебель у этого вида желтоватый с серым или коричневым оттенком, в диаметре до десяти сантиметров, без боковых побегов.
Ребра разделены бороздками, извилистые. Ареолы слабо опушеные. Цветки желтовато-белые.