Цилиндропунция деревцевидная это кустарник три метра в высоту. Побеги тонкие, цилиндрические, в длину достигают десять сантиметров, а в диаметре полтора сантиметра. Побеги так же имеют узкие вытянутые бугорки.
Колючки желтые, редкие направлны вниз, до пяти сантиметров в длину. Цветки желто-бронзовые, до двух сантиметров в длину.