Эхиномастус Джонсона имеет стебель от шаровидной до цилиндрической формы, серо-зеленого цвета, без боковых побегов.
Низкие ребра разделены на небольшие бугрки. В количестве ребер насчитывется от восемнадцати до двадцати. Красные или красновато-серые колючки прямые, тонкие, два сантиметра в длину. Около десяти центральных колючек, в длину вырастают до четырех сантиметров.
Цветки самой разнообразных расцветок: от красных, пурпурно-розовых до белых. В диаметре достигают до шести с половиной сантиметров. Плоды до полутора сантиметров в длину.
