У Эхиномастуса марипосского стебель имеет цилиндрическую или шаровидную форму и не образует боковые побеги. В высоту он достигает девять сантиметров, а в диаметре шесть сантиметров.
Ребра в количестве около двадцати двух, разделены на бугорки. Тонкие, щетинковидные колючки, в количестве от двадцати пяти до тридцати пяти, расположенны радиально. В длину колючки достигают пять миллиметров. У этого кактуса от четырех до шести игловидных центральных колючек, а в длину они достигают от пяти миллиметра до полутора сантиметра. Все колючки белые с коричневыми концами.
Цветки, около двух сантиметров в длину и в диаметре, имеют розовый окрас. Плоды шаровидные.
