У Гилоцереуса трехгранного стебель зеленый, ползущий, до десяти сантиметров в высоту, с боковыми побегами. Ребра без бугорков, крупные, извилистые.
Колючки, в количестве от пяти до восьми, короткие, жесткие, зеленоватые со временем темно-коричневые, от четырех до семи миллиметров в длину. Цветки белые, крупные.
