У Микрантоцереуса желтоцветкового стебель достигает до семидесяти пяти сантиметров в высоту, в диаметре пять. Ребра в количестве шестнадцати.
Радиальные колючки до тридцати штук, стекловидные, короткие,. Центральные колючки в количестве от пяти до девяти, до двух сантиметров в длину. Цветки желто-оранжевые, в длину два сантиметра, в диаметре шесть миллиметров. Плоды красноватые. Семена черные, глянцевые.
