Цилиндропунция Кляйна это кустарник до двух с половиной метров в высоту. Побеги до двадцати сантиметров в длину, в диаметре полтора сантиметра, с выраженными бугорками.
Колючки иногда отсутствуют, а так достигают в длину до трех сантиметров. Цветки в центре зеленоватые, а по краям красноватые.
